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          微生物所在人工固碳循環(huán)研究中取得進(jìn)展

          來(lái)源:微生物研究所 2031 2021-12-30

            顆粒在線訊:工業(yè)快速發(fā)展導(dǎo)致二氧化碳等溫室氣體排放不斷增加,促使各國(guó)加速開發(fā)二氧化碳捕集利用技術(shù)。其中,設(shè)計(jì)和創(chuàng)建具有高效生物固碳能力的酶、生化途徑、工程生物或微生物組,已成為合成生物固碳領(lǐng)域的研究熱點(diǎn)。 

            自然界中,植物和微生物可利用六條天然固碳途徑將二氧化碳轉(zhuǎn)化為有機(jī)物,其中重要途徑之一就是以1,5-二磷酸核酮糖羧化酶/加氧酶(Rubisco)為核心固碳酶的卡爾文循環(huán)。為突破天然固碳途徑的低效率,2016年和2021年,Science雜志先后報(bào)道了人工設(shè)計(jì)的非天然固碳途徑CETCH循環(huán)(由德國(guó)馬普陸地微生物研究所完成)和ASAP途徑(由中科院天津工業(yè)生物技術(shù)研究所完成),可在無(wú)細(xì)胞系統(tǒng)中將二氧化碳分別轉(zhuǎn)化為乙醛酸和淀粉。這些天然和人工固碳途徑較長(zhǎng),一般包含十步以上的生化反應(yīng)。一般情況下,生化途徑的反應(yīng)步驟越多,整體效率越低。然而,生物固碳途徑必須由很多反應(yīng)步驟組成嗎?能否設(shè)計(jì)一條比天然固碳途徑反應(yīng)數(shù)更少的人工固碳途徑?如果可以,這樣的人工固碳途徑需要在怎樣的條件下運(yùn)轉(zhuǎn),能夠達(dá)到多高的固碳效率?  

            圍繞上述問題,中國(guó)科學(xué)院微生物研究所研究人員基于生化反應(yīng)熱力學(xué)和動(dòng)力學(xué)計(jì)算,設(shè)計(jì)出新的最小化的人工固碳循環(huán)。該循環(huán)包含四步反應(yīng),分別由丙酮酸羧化酶(PYC)、草酰乙酸乙?;饷福∣AH)、乙酸-CoA連接酶(ACS)和丙酮酸合酶(PFOR)催化,被命名為POAP循環(huán)(如圖)。在四步反應(yīng)中,由丙酮酸合酶和丙酮酸羧化酶催化的兩步反應(yīng)均為固碳反應(yīng)。POAP循環(huán)每運(yùn)行一輪,可以轉(zhuǎn)化兩分子二氧化碳生成一分子草酸,消耗兩分子ATP和一分子還原力。 

            在POAP循環(huán)的四步反應(yīng)中,關(guān)鍵且較難實(shí)現(xiàn)的是由丙酮酸合酶(PFOR)催化的還原羧化反應(yīng)。正常情況下,在生物體內(nèi)能夠觀察到的反應(yīng)是PFOR催化丙酮酸氧化脫羧并釋放二氧化碳。而實(shí)現(xiàn)POAP循環(huán),需要把PFOR催化的氧化脫羧反應(yīng)逆轉(zhuǎn)過來(lái),即催化乙酰輔酶A還原羧化生成丙酮酸。該還原羧化反應(yīng)在熱力學(xué)上不利,需要較大的還原力來(lái)推動(dòng)反應(yīng)發(fā)生。因此,研究人員考慮在厭氧條件下利用低電勢(shì)的電子供體提供足夠的還原力來(lái)驅(qū)動(dòng)反應(yīng)。通過合成并測(cè)試一系列低電勢(shì)的電子供體鐵氧還蛋白(Ferredoxin,F(xiàn)d),研究人員發(fā)現(xiàn)來(lái)源于Hydrogenobacter thermophiles的Fd2對(duì)PFOR的還原羧化反應(yīng)具有較強(qiáng)的推動(dòng)作用。以Fd2作為電子供體,可以驅(qū)動(dòng)熱纖梭菌(Clostridium thermocellum)來(lái)源的異型四聚體丙酮酸合酶實(shí)現(xiàn)乙酰輔酶A的還原羧化,這也是異型四聚體的丙酮酸合酶首次在體外實(shí)現(xiàn)還原羧化反應(yīng)。通過進(jìn)一步合成測(cè)試,研究人員獲得了構(gòu)建POAP循環(huán)所需要的其他三個(gè)酶PYC、OAH和ACS,采用先分別構(gòu)建POAP半循環(huán)、再將兩個(gè)POAP半循環(huán)整合在一起的策略,構(gòu)建了具有功能的POAP循環(huán)。以13C標(biāo)記的碳酸氫鈉為底物進(jìn)行測(cè)試,檢測(cè)到POAP循環(huán)的產(chǎn)物13C標(biāo)記的草酸,并測(cè)定出POAP循環(huán)的二氧化碳固定速率為8.0 ± 1.8 nmol CO2/min/mg固碳酶,草酸的轉(zhuǎn)換數(shù)為5 摩爾/摩爾POAP循環(huán)酶,固碳效率較高。 

            理論上,構(gòu)成一個(gè)最小固碳循環(huán)需要三步反應(yīng)。POAP循環(huán)只含有四步反應(yīng),接近理論最小值,是目前經(jīng)過實(shí)驗(yàn)證實(shí)的最小化的人工固碳循環(huán)。由于途徑短,在PFOR活性遠(yuǎn)低于CETCH循環(huán)固碳酶活性的情況下,POAP循環(huán)的二氧化碳固定速率仍超過了含有十二步反應(yīng)的CETCH循環(huán)。POAP循環(huán)可以在厭氧和較高溫度(50°C)下實(shí)現(xiàn)二氧化碳固定,為了解和研究地球早期生物如何進(jìn)行二氧化碳固定提供了新模型,并為二氧化碳的人工生物轉(zhuǎn)化提供了新的可選途徑。 

            相關(guān)研究成果以A Minimized Synthetic Carbon Fixation Cycle為題,于12月28日在線發(fā)表在ACS Catalysis上。研究工作得到中科院戰(zhàn)略性先導(dǎo)科技專項(xiàng)預(yù)研項(xiàng)目、中科院重點(diǎn)部署項(xiàng)目等的資助。 

          由四步生化反應(yīng)組成的POAP循環(huán)

          由四步生化反應(yīng)組成的POAP循環(huán)

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