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          解碼“基因組學(xué)之父”桑格:測序,測序,測序

          來源:中國科學(xué)報 2213 2019-08-13

          ??“桑格當(dāng)之無愧地被稱為‘基因組學(xué)之父’,他的工作為人類讀取和理解基因代碼奠定了基礎(chǔ),徹底變革了生物學(xué)并極大促進(jìn)了當(dāng)今的醫(yī)學(xué)發(fā)展。”

          有一天,65歲的英國生物化學(xué)家弗雷德里克·桑格(Frederick Sanger)突然停下手中的試驗,轉(zhuǎn)身走出實驗室,宣布自己正式退休。那一年是1983年。因為他覺得,自己的年紀(jì)已經(jīng)足夠大了,需要開始另一種生活。

          此后,在家專心打理花園的桑格逐漸淡出了人們的視野。直到30年后的2013年11月19日,他在沉睡中于英國劍橋郡阿登布魯克醫(yī)院安然離世,享年95歲。弗雷德里克·桑格這個名字,以及與他有關(guān)的種種傳奇往事,再度被世人的記憶所喚醒。

          在分子生物學(xué)、生物化學(xué)等學(xué)科領(lǐng)域的教科書中,以桑格的名字命名的試劑、測序法是無法繞過的經(jīng)典教學(xué)內(nèi)容,桑格也由此被今天的年輕學(xué)子們奉為“祖師爺”級的人物。

          事實上,兩次獲諾貝爾獎,就足以說明桑格在世界科學(xué)界所擁有的分量和地位。因完整測定了胰島素的氨基酸序列,證明蛋白質(zhì)具有明確構(gòu)造,桑格獨享1958年諾貝爾化學(xué)獎;上世紀(jì)70年代末,他提出快速測定脫氧核糖核酸(DNA)序列的技術(shù)“雙脫氧終止法”,即被稱作“桑格法”的雙脫氧核苷酸鏈終止法,與另外兩名科學(xué)家共享1980年諾貝爾化學(xué)獎。

          在科學(xué)史上,桑格成為繼瑪麗亞·居里、萊納斯·鮑林、約翰·巴丁之后,第四位兩度獲頒諾貝爾獎,且是迄今為止唯一兩次獲得化學(xué)獎的科學(xué)家。

          英國維康信托基金會主席杰里米·法萊爾評價:“桑格當(dāng)之無愧地被稱為‘基因組學(xué)之父’,他的工作為人類讀取和理解基因代碼奠定了基礎(chǔ),徹底變革了生物學(xué)并極大促進(jìn)了當(dāng)今的醫(yī)學(xué)發(fā)展?!?/span>

          從認(rèn)識蛋白質(zhì)開始

          1918年8月13日,桑格出生于英國格洛斯特郡,父親是一名內(nèi)科醫(yī)師,曾作為傳教士在中國短暫工作,后因健康原因返回英國,母親則是從事棉花加工生意的商人后代。

          桑格原本打算跟隨父親的步伐邁入醫(yī)學(xué)界,但高中畢業(yè)進(jìn)入劍橋大學(xué)學(xué)習(xí)后,轉(zhuǎn)而對生物化學(xué)產(chǎn)生了濃厚興趣,決定成為一名科學(xué)家。而當(dāng)時的劍橋,正好擁有諸多生物化學(xué)先驅(qū)。

          上學(xué)時桑格表現(xiàn)平平,從中學(xué)一直到博士畢業(yè)之前,他幾乎沒有獲得過任何獎學(xué)金,然而父母也沒有一味要求他在考試中取得高分,而是盡量給他一個寬松的家庭環(huán)境,父親的劍橋背景和富裕的家境幫了他不少忙。

          1944年,桑格在劍橋取得化學(xué)專業(yè)的博士學(xué)位,留校跟隨正在研究胰島素的生物化學(xué)系新任教授阿爾伯特·查爾斯·奇布諾爾開始了博士后研究,專注于為氨基酸排序的工作。

          胰島素在人體的糖代謝過程中起到重要作用,如果胰島素分泌不足,就有可能導(dǎo)致糖尿病。科學(xué)家開始關(guān)注胰島素的生化性質(zhì),不僅僅因為它具有醫(yī)學(xué)的應(yīng)用前景,還因為它是當(dāng)時僅有的幾種能夠被提純的蛋白質(zhì)。

          在桑格涉足胰島素研究之時,世界生物學(xué)界對于蛋白質(zhì)的認(rèn)知存在較大分歧,一種觀點認(rèn)為,蛋白質(zhì)沒有明確的化學(xué)組成和結(jié)構(gòu);而另一派則堅持認(rèn)為蛋白質(zhì)具有結(jié)構(gòu),并且可以通過化學(xué)方法測定氨基酸的排列順序。

          桑格以牛胰島素作為樣本,開始確定胰島素分子中的51個氨基酸序列。他發(fā)現(xiàn)了一種方法,可以截斷連接氨基酸鏈的“橋”,這使得他可以研究單個的氨基酸片段,然后他又將這些片段重新組合成氨基酸長鏈,進(jìn)而推導(dǎo)出完整的胰島素結(jié)構(gòu)。1953年,桑格成功地測序了胰島素的氨基酸序列。

          “這是非常不容易的工作?!敝袊茖W(xué)院院士、分子生物學(xué)家洪國藩告訴《中國科學(xué)報》記者,桑格在科學(xué)界對蛋白質(zhì)的認(rèn)識還很匱乏的情況下,不但明確回答了蛋白質(zhì)具有結(jié)構(gòu),而且成為世界上第一個搞清楚其氨基酸排列順序的人。

          1965年,我國科學(xué)家用人工方法合成了具有生物活性的結(jié)晶牛胰島素,在世界上首次實現(xiàn)蛋白質(zhì)的人工合成。在洪國藩看來,我國科技史上這項與“兩彈一星”齊名的偉大成就,是桑格的研究與中國科學(xué)最為直接而緊密的連接點。

          “如果沒有桑格搞清楚胰島素的結(jié)構(gòu),我們就沒有辦法進(jìn)行人工合成。”洪國藩說,更為重要的是,中國科學(xué)家成功實現(xiàn)胰島素的人工合成,反過來支持并證明了桑格蛋白質(zhì)測序的正確性。

          桑格測定蛋白質(zhì)序列的方法至今仍有應(yīng)用,而他所使用的2,4-二硝基氟苯此后被稱為“桑格試劑”,該試劑與自由氨基的反應(yīng)則被稱作“桑格反應(yīng)”。這項工作為他贏得了第一個諾貝爾獎。

          “測序,測序,測序”

          獲得1958年的諾貝爾化學(xué)獎之后,來自世界各地的訪學(xué)和學(xué)術(shù)報告邀請紛至沓來,而桑格卻并不打算離開自己所鐘愛的實驗室生活,他一一婉拒,繼續(xù)躬耕實驗。

          1962年,桑格參與籌建了隸屬于英國醫(yī)學(xué)研究委員會的分子生物學(xué)實驗室,這個實驗室后來成為世界生命科學(xué)領(lǐng)域的“研究圣地”,迄今為止誕生了13位諾貝爾獎獲得者。然而作為創(chuàng)建元老的桑格,卻始終沒有擔(dān)任太多職務(wù),因為“參與管理事務(wù)太痛苦了”。

          在研究年鑒上,桑格曾以“測序,測序,測序”作為題目總結(jié)自己一生的工作。上世紀(jì)70年代,隨著生命科學(xué)研究的深入,桑格將注意力轉(zhuǎn)向RNA和DNA的測序研究。

          而對于桑格此后致力于發(fā)明一種全新的DNA測序方法,英國同行之間流傳著一段頗耐人尋味的小故事。

          曾在英國牛津大學(xué)留學(xué)的中科院北京生命科學(xué)研究院副院長高福告訴記者,當(dāng)時有很多科學(xué)家在分子生物學(xué)實驗室排隊測序,桑格也不例外。然而有一天,排隊等待的低效率讓桑格很是煩惱,于是,他決心要從漫長的隊伍中離開,自己去發(fā)明一種更為快速的測序方法。

          “原本排著隊就能在Nature或Science這樣的雜志上發(fā)篇論文,可是桑格說他不排隊了,要去做一個創(chuàng)新性的新方法?!备吒Uf,桑格的選擇,也從一個側(cè)面印證了英國科學(xué)界優(yōu)良的創(chuàng)新型研究傳統(tǒng)。

          桑格最先想到了自己曾用于蛋白質(zhì)測序的“拼圖法”,但他很快發(fā)現(xiàn)這種手段在面對信息量龐大的DNA時毫無用武之地。自認(rèn)為并不聰明的桑格,曾說自己“只是個一輩子在實驗室里瞎胡混的家伙”,埋頭實驗室成為他的“成功密鑰”。

          最終,后來被稱為“桑格法”的“雙脫氧終止法”測序技術(shù)應(yīng)運(yùn)而生,他利用該技術(shù)成功定序出一種噬菌體的基因組序列。這也是科學(xué)家首次完整的基因組定序工作。相較于當(dāng)時其他的DNA測序方法,桑格的技術(shù)使用了較不具毒性的材料。這一系列工作,為他贏得了第二次諾貝爾獎。

          桑格兩次獲諾獎的研究,都涉及生物大分子的一級結(jié)構(gòu)及其測序,英國醫(yī)學(xué)研究理事會前主任科林·布萊克莫爾評價,桑格發(fā)明的兩項技術(shù)打開了分子生物學(xué)、遺傳學(xué)和基因組學(xué)研究領(lǐng)域的大門。

          隨著基因組研究的飛速發(fā)展,科學(xué)家開始想要破解上帝留給人類的基因“天書”。而作為第一代測序技術(shù)的“桑格法”,成為1990年正式啟動的“人類基因組”計劃得以順利開展的關(guān)鍵。

          因為厭煩了排隊,桑格轉(zhuǎn)而自己研究起新的DNA測序方法。關(guān)于這段有些傳奇色彩的故事,高福認(rèn)為它對當(dāng)下中國的科學(xué)界有很大啟發(fā)?!叭绻8裰皇桥胖犜贜ature上發(fā)了幾篇論文,那么相對于發(fā)明一種新的測序方法來說,究竟哪個貢獻(xiàn)大呢?”

          盡管桑格幾十年來一直身處實驗室一線并且成名很早,但如今若要在公共檢索系統(tǒng)中查找,他一生發(fā)表的論文和評述不會超過百篇。即便在他一年之內(nèi)發(fā)表論文最多的1969年,文章總數(shù)量也僅有5篇。然而,他于1977年與人合作撰寫的關(guān)于DNA測序的文章,發(fā)表至今已被引用超6萬次。

          “在我們當(dāng)前的科學(xué)環(huán)境中,大家急急忙忙多發(fā)了幾篇論文,數(shù)量上去了不少,但是對于科學(xué)的真正貢獻(xiàn)究竟在哪里呢?”在高福看來,桑格的追求和成就值得今天的中國科學(xué)家深思。

          “高級技術(shù)員”的歷史價值

          桑格被認(rèn)為是“20世紀(jì)英國科學(xué)的英雄人物”,他在65歲時宣布退休的決定讓很多人詫異。而他解釋說,到了這般年紀(jì)還作研究,如果達(dá)不到自己期望的水準(zhǔn)心里會覺得不安,不如把位置讓給年輕人。

          1993年,英國維康信托基金會和醫(yī)學(xué)研究理事會在劍橋大學(xué)成立了桑格中心,后改名為桑格研究院。有趣的是,這所以桑格的名字命名的著名研究機(jī)構(gòu)有一項觀光項目,就是帶著大家去欣賞桑格退休后精心打理的花園。

          回望科學(xué)生涯,桑格在為自己所寫的唯一一篇自傳中總結(jié)道:“對于科學(xué)家來說,行動就是做實驗?!?/span>

          因為桑格的重要貢獻(xiàn)都是在生物大分子的測序技術(shù)方面,曾有另一位諾獎獲得者對桑格作出這樣的評價:“他是一個高級技術(shù)員。”

          “這樣的評價其實并沒有錯。桑格確實擁有很強(qiáng)的技術(shù)能力,而且,他所發(fā)明的技術(shù)非常重要?!备吒Uf,對于科學(xué)家而言,找到適合自己個性的角色至關(guān)重要。

          而在中科院北京基因組所研究員于軍看來,技術(shù)有其“時效性”的問題,盡管桑格的蛋白質(zhì)測序技術(shù)和DNA測序技術(shù)今天還有應(yīng)用,但使用范圍已經(jīng)非常有限。因此,桑格的貢獻(xiàn),要放在歷史的大背景下來理解。

          “諾貝爾獎頒發(fā)給從事技術(shù)方法研究的科學(xué)家,這種情況并不多見,更多的是因為科學(xué)發(fā)現(xiàn)而獲獎?!庇谲娬f,桑格發(fā)明的測序技術(shù)正是他在科學(xué)界能夠擁有獨特地位的標(biāo)志性特征。

          “沒有桑格對測序技術(shù)的發(fā)明,就沒有基因組學(xué)的概念出來?!闭铝τ谛乱淮鷾y序儀研究的中科院北京基因組研究所副研究員任魯風(fēng)評價說,“桑格法”是一個里程碑式的DNA測序技術(shù)。

          1980年,應(yīng)中科院上海生物化學(xué)研究所時任所長王應(yīng)睞的邀請,桑格曾來到中國進(jìn)行短暫訪問?!皡⒂^交流中他發(fā)現(xiàn),有些實驗藥品、生物制品我們買不到,桑格就一一記下來,回到英國后的一個禮拜之內(nèi),他就把那些用品寄往中國。”洪國藩院士回憶。

          洪國藩在劍橋進(jìn)修期間曾跟隨桑格從事研究,兩人結(jié)下深厚友誼。在他的印象中,桑格性格溫和,但也不是很多人以為的沉默寡言?!懊慨?dāng)聽到你有新的科學(xué)想法,他就會非常高興?!焙閲J(rèn)為,正是興趣和專注成就了桑格輝煌的科學(xué)人生。


          本文轉(zhuǎn)載自《中國科學(xué)報》,作者:郝俊。


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          桑格反應(yīng)(Sanger Reaction):在弱堿性溶液中,氨基酸的α-氨基很容易與2,4-二硝基氟苯作用,生成穩(wěn)定的黃色2,4-二硝基苯氨基酸。該反應(yīng)由弗雷德里克·桑格首先發(fā)現(xiàn),所以此反應(yīng)又稱桑格反應(yīng),2,4-二硝基氟苯被稱為桑格試劑。

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